Insiden Shin Megami Tensei 20XX
Semua bermula pada game Shin Megami Tensei 20XX Devil’s Colloseum, dimana 2 bersaudara laki-laki dan perempuan hidup di sebuah tempat yatim piatu bernama Silent Night. Suatu ketika sang adik perempuan dirasuki oleh Lucifer dan mengirim tempat Silent Night bersama saudara laki-lakinya pada sebuah tempat labirin gelap yang penuh dengan monster.
Sang lelaki kemudian bertemu dengan sosok pria menggunakan kursi roda dan memberikannya sebuah alat COMP untuk bertarung. Dengan alat tersebut, dia pun berpetualang di labirin dan menyelamatkan adik perempuannya. Dari beberapa pilihan ending, diketahui tidak sang adik perempuan tidak dapat diselematkan oleh sang saudaranya.
Kemudian dilanjutkan dengan Shin Megami Tensei 20XX, menceritakan kota Tokyo yang tiba-tiba dipenuhi oleh makhluk Demon. Duta besar Amerika Serikat menggunakan senjata Intercontinental Ballistic Missile atau ICBM untuk memusnahkan semua Demon yang ada termasuk kota Tokyo sendiri.
30 tahun kemudian, peradaban manusia sudah mulai membaik berkat organisasi Order of Messiah. Sang Protagonist yang tinggal di tempat kumuh di kota Tokyo Millennium mendapatkan sebuah alat COMP dan Beast Ring dari orang yang sama pada game Shin Megami Tensei sebelumnya. Pria tersebut memberikan instruksi bahwa kebebasan umat manusia akan terancam oleh suatu organisasi bernama Center dan meminta sang Protagonist untuk menguasainya dengan menjadi semakin kuat.
Ada 4 rute ending pada game ini, namun ending yang mempengaruhi game Shin Megami Tensei selanjutnya adalah ending Law. Ending ini berakhir dengan Protagonist bekerja dibawah naungan Center. Organisasi tersebut memiliki sebuah rencana berupa Chimera Project yang merupakan proyek bagaimana Protagonist Shin Megami Tensei II bernama Aleph diciptakan.
Timeline Shin Megami Tensei II
Shin Megami Tensei II terjadi puluhan tahun kemudian setelah insiden Shin Megami Tensei pertama ending Neutral terjadi. Game ini berfokus pada karakter Protagonist bernama Aleph untuk menyelamatkan umat manusia dimana kondisi mereka di Tokyo Millennium sudah semakin sulit akibat berbagai masalah dan serangan Demon.
Sementara itu, akhir cerita dunia Shin Megami Tensei II berhenti sampai di sini. Tidak diketahui secara jelas ending canon seperti apa yang terjadi pada dunia tersebut. Namun pada ending Neutral, Aleph berhasil menyelamatkan umat manusia dengan membunuh YHVH. Sebagai hukumannya, YHVH memberikan dia kutukan berupa dosa besar atas apa yang telah dia lakukan dalam menyelamatkan umat manusia.
